O Joinville Esporte Clube, foi fundado em 29 de janeiro de 1976, a partir de uma fusão envolvendo apenas o departamento de futebol das equipes de América e Caxias, ambos da cidade de Joinville.

O Joinville tornou-se um clube independente e de maior sucesso do futebol profissional de Santa Catarina. Em 33 anos de história, o JEC como é popularmente chamado, conquistou 12 títulos estaduais.

Sua trajetória de vitórias iniciou com a conquista do título Estadual de 1976, já no ano de sua fundação. Continuou sua saga de sucesso, com a histórica marca de 8 títulos catarinenses consecutivos (octacampeonato) entre os anos de 1978 a 1985. Depois vieram os títulos de 1987 e o bicampeonato 2000 e 2001.

No cenário nacional, o JEC disputou vários campeonatos da série A, e teve sua melhor campanha em 1985 quando ficou na oitava posição, sendo desclassificado pelo Coritiba, que acabou sagrando-se campeão Brasileiro daquele ano. Em 1986 o JEC voltou a fazer uma bela campanha ficando na décima-segunda posição.

Dos atletas que passaram pelo JEC, alguns destacaram-se no cenário nacional, como foi o caso de Carlos Alberto, Lico, Barbieri, Paulo Egídio, Pingo, Roberto Gaúcho, Wagner Bacharel, Edinho Baiano, e mais recentemente revelando Edgar (Sâo Paulo, Vasco e futebol portugues), Douglas (na Holanda) e Ramires (Cruzeiro e Benfica), entre outros.

O maior ídolo da torcida Jequeana de todos os tempos chama-se Reinaldo Antonio Baldesin, o Nardela, que jogou pelo clube de 1980 a 1994, se constituindo no maior artilheiro do clube com 130 gols.